El proyecto del Tren Maya tendrá que volver a su ruta original debido a problemas de subsuelo y la presencia de numerosas zonas arqueológicas en los alrededores de la comunidad de Cobá. En junio de 2019 se anunció que la ruta de este transporte se modificaría para ahorrar unos 5 mil 500 millones de pesos.
El plan contemplaba que el tren se moviera de la ciudad de Valladolid a Cobá, y de ahí a Tulum, para finalmente llegar hasta Cancún, con lo que se disminuiría el recorrido en 55 kilómetros. El director general de Fonatur expuso que se buscarán optimizar otros aspectos de este proyecto para que no se rebase la inversión total de 139 mil millones de pesos.
